LiverHealthX - Análise integrada da função hepática

Principais objetivos técnicos do projeto LiverHealthX: I. Desenvolver procedimento para quantificação de expressão de miRNAs e de mtDNA-ccf, adaptável a microestruturas fluídicas O grupo de Diversidade Genética do i3S irá trabalhar na definição dos passos essenciais do procedimento de deteção dos biomarcadores genéticos definidos. Simultaneamente utilizará a sua experiência em manipulação de ácidos nucleicos para definir procedimentos eficazes de amplificação isotérmica. A biosurfit trabalhará em conjunto com o co-promotor no sentido de simplificar os procedimentos o mais possível com vista à compatibilização com as suas tecnologias proprietárias de diagnóstico junto do paciente. II. Desenvolver um sistema integrado de teste baseado em biomarcadores proteicos, genéticos e celulares Reconhecendo a complexidade do desenvolvimento da solução LiverHealthX, a biosurfit dispõe de bases sólidas, tanto a nível de infraestrutura como a nível de conhecimento, para levar este projeto a bom porto. Neste campo, o projeto requer da empresa (a) adaptações de designs existentes para esta nova aplicação tanto para os biomarcadores proteicos e genéticos identificados como para células (plaquetas) e (b) desenvolvimento de novas arquiteturas que permitam incorporar todos os passos necessários à deteção simultânea de vários marcadores, com base nos procedimentos desenvolvidos no ponto I. III. Integrar descartável com ferramentas de hardware e software, baseado em algoritmos de machine learning, que permitam a deteção específica de vários biomarcadores em simultâneo Para o desenvolvimento do equipamento de leitura/deteção, a biosurfit utilizará o know-how que já tem implementado nos produtos que comercializa, essencialmente no que diz respeito às funções necessárias ao controlo e leitura do disco fluídico descartável. A biosurfit investiu recentemente no desenvolvimento de um novo módulo de deteção por fluorescência, havendo já algum trabalho desenvolvido na área. Este módulo será ajustado para as aplicações descritas na presente candidatura, nomeadamente a deteção eficaz de ácidos nucleicos por fluorescência IV. Obter um desempenho de diagnóstico com uma performance em pre-design freeze com sensibilidade e especificidade superiores a 90%. A biosurfit propõe-se a atingir sensibilidade e especificidade superiores a 90% para todos os parâmetros em teste. A especificidade dos processos de deteção em qualquer um dos casos será otimizada por via de reagentes, com a escolha dos reagentes mais adequados, e com o ajuste das respetivas concentrações. Os tempos de reação/incubação em cada passo necessário à deteção serão igualmente otimizados no sentido de atingir a maior especificidade possível. A otimização da sensibilidade será assegurada tanto ao nível do dispositivo de microfluídica como ao nível do sistema de aquisição e processamento de sinal. No caso do dispositivo de microfluídica, a sensibilidade poderá ser maximizada através de várias estratégias, tais como: (a) a criação de várias zonas de deteção; (b) a diluição adequada da amostra; (c) a integração de unidades de processamento de amostra dentro do próprio dispositivo. Relativamente à aquisição de sinal, serão estudadas as melhores condições para aquisição, nomeadamente ao nível da seleção de espectro de irradiação da amostra, intensidade de irradiação, adequada seleção de filtros e tempo de aquisição de sinal.